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Pluto Bio

Von Pluto Bioinformatics

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Pluto Bio Medien

Pluto Bio Demo - RNA-seq, ChIP-seq, CUT&RUN, ATAC-seq and more
Transform raw sequencing data (FASTQs) into a wide variety of interactive visualizations
Pluto Bio Demo - Publication-ready plots
Customize colors, size, legend position, and more. Export figures in png or vector format. NEW: Create multi-panel figures with the Storyboard feature.
Pluto Bio Demo - Explore and compare published data
Pluto includes over 14,000 published experiments, which you can instantly copy into your private lab space for your own interactive analysis. Additional data is being added monthly!
Pluto Bio Demo - Automated progress reporting
View real-time reports on raw data, experiments, and project status by program, team, and user
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Pluto Bio-Bewertungen (14)

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Pluto Bio-Bewertungen (14)

4.8
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QD
Unternehmen mittlerer Größe (51-1000 Mitarbeiter)
"Massen-RNA-Seq-Analyse und Diagrammerstellung auf Pluto"
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Pluto macht es mir leicht, meine Daten zu organisieren und bioinformatische Analysen durchzuführen, ohne programmieren zu müssen. Pluto ermöglicht es mir auch, eigenständig gute repräsentative Abbildungen zu erstellen. Ich mag, dass alle meine Daten am selben Ort gespeichert werden können und mir die Flexibilität geben, mehr Diagramme und Interpretationen zu erstellen, während ich analysiere. Ich mag auch, dass sie eine reaktionsschnelle Chat-Funktion haben, die schnell auf meine Anfragen antwortet. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Es wäre hilfreich, mehr Arten von statistischen Analysen auf Pluto durchzuführen. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

ST
Unternehmen (> 1000 Mitarbeiter)
"Benutzerfreundliche Oberfläche"
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Unser Team hat wenig Wissen darüber, wie man Transkriptomdaten mit komplexen Programmiersprachen (R, Python) analysiert. Pluto macht es jedem von uns leicht, unsere eigenen Daten anzusehen und Balkendiagramme, Vulkanplots usw. zu erstellen. Ich komme häufig zurück und erstelle später neue Abbildungen/vergleichende Analysen meiner Datensätze, wenn ich ein neues Diagramm benötige. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Ich möchte noch mehr Analysetypen zur Auswahl in Pluto sehen. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Thomas R.
TR
Kleinunternehmen (50 oder weniger Mitarbeiter)
"Meine Bewertung von Pluto für die Gewebetechnik"
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Pluto ist nützlich für die gemeinsame Nutzung von Daten und die Visualisierung, insbesondere für die 'einfachen' biologischen Tests, die ich durchführe. Ich kann mehrere Tests an einem einfachen Ort integrieren und sowohl Bilder als auch Text hinzufügen. Es ist cloudbasiert, sodass ich von überall aus an meinen Daten arbeiten kann, sogar von meinem Telefon aus (was ich schon einmal gemacht habe!). Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Die Barriere für die Benutzerfreundlichkeit ist ziemlich hoch, ich konnte nicht so viele Kollegen einbinden, wie ich es mir gewünscht hätte. Die Grafiken sind nicht publikationsreif: Wenn Werte unter 1 liegen, werden keine Dezimalstellen angezeigt. Legenden sind nicht zur Klarheit bearbeitbar und können keine Einheiten enthalten. Im Formatieren von Beispieldaten kann Pluto keine numerischen Werte ziehen, wenn Text enthalten ist. Dies macht das Hinzufügen von 'Zielen' wie Konzentrationen (zum Beispiel 5uM) unmöglich. Kein Bliss-Modellieren oder Anpassen von Kurven für IC50s. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Verifizierter Benutzer in Biotechnologie
BB
Unternehmen (> 1000 Mitarbeiter)
"Eine wirklich durchgängige Bioinformatik-Plattform"
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Ich bin ein erfahrener Bioinformatik-Forscher, der persönlich zahlreiche Analyse- und Visualisierungsplattformen für verschiedene -Omics-Typen ausprobiert hat. Ein großer Vorteil dieser Plattform ist, dass sie vollständig von Anfang bis Ende funktioniert. Ich habe keine andere Plattform gefunden, die große Sequenzierungsdateien verarbeiten, Qualitätskontrollen durchführen und interpretierbare und publikationsreife Analysen erstellen kann.

Ich habe Daten über diese Plattform geteilt (was ziemlich einfach ist) mit Forschern, die nur begrenzte Erfahrung in der Bioinformatik haben. Trotz dieses Mangels ist die Plattform so intuitiv, dass sie leicht in der Lage sind, die Analyse bis zu diesem Punkt zu verstehen und schnell in der Lage sind, neue Analysen zu erstellen. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Forscher wollen immer mehr Funktionen und Analysen, daher möchte ich einfach ein kontinuierliches Wachstum sehen. Ich benutze diese Plattform seit über einem Jahr und bin beeindruckt von dem kontinuierlichen Wachstum und der Entwicklung. Neue Experimente und Analysen werden häufig hinzugefügt, um diese Plattform auf dem neuesten Stand der Anforderungen für die Bioinformatikanalyse zu halten, aber eine kontinuierliche Entwicklung wird notwendig sein.

Umfassende Qualitätskontrollen werden durchgeführt. Da jedoch so viele Informationen generiert werden, kann es schwierig sein, schnell zu erkennen, ob es Probleme mit den Daten gibt. QC-Benachrichtigungen könnten ein Bereich zur Verbesserung sein. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Payton M.
PM
Kleinunternehmen (50 oder weniger Mitarbeiter)
"Massen-RNA-Seq-Analyse und Abbildungen in Pluto"
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Der hilfreichste Teil von Pluto ist der Methodenteil, der mit jeder Abbildung geliefert wird. Es war so einfach, das Manuskript zu schreiben, wenn jede Abbildung genau beschreibt, was getan wurde, um sie zu erstellen. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Es gab wirklich nichts, was mir nicht gefiel, das Einzige, was ich gerne sehen würde, sind mehr Optionen zur Anzeige von Daten. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Verifizierter Benutzer in Forschung
BF
Kleinunternehmen (50 oder weniger Mitarbeiter)
"Großartige Plattform für Biologen und Informatiker mit minimalem Zeitaufwand."
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Pluto macht das Ausführen der eher alltäglichen Verarbeitungsteile der NGS-Analyse einfach, mit sehr wenig Zeitaufwand für den Benutzer. Als jemand, der Bioinformatiker ist, genieße ich es nicht, die grundlegenden Teile der Informatikanalysen (wie QC und die Erstellung von Zählmatrizen) durchzuführen, und Pluto ermöglicht es mir, ein paar Minuten mit dem Hochladen der Daten zu verbringen, damit ich mich auf die komplexeren Teile der nachgelagerten Analysen und auf die Softwareentwicklung konzentrieren kann. Sie bieten sehr gründliche und umfassende QC-Metriken, sodass ich, wenn ich die Pipeline ändern oder erneut ausführen muss, dies einfach tun kann, indem ich eine Kopie des Experiments erstelle, ein paar Parameter ändere und basierend auf den QC-Problemen, die ich sehe, erneut ausführe. Ich kann das ernsthaft in weniger als 5 Minuten meiner Zeit tun. Ich denke auch, dass die Möglichkeit, GEO-Studien von fastq bis zur Analyse zu importieren, sehr leistungsstark ist und mir viel Zeit spart, die ich damit verbringen würde, fastqs herunterzuladen und mit Internetbandbreitenproblemen von SRA umzugehen und sie erneut zu analysieren, um mit den Pipelines und Parametern übereinzustimmen, die ich verwenden möchte; die Plattform macht das Ausführen reproduzierbarer Analysen viel reibungsloser. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Ich würde gerne mehr Tutorials/Dokumentationen/Videos sehen, wie man verschiedene Teile des MultiQC-Berichts interpretiert und Beispiele dafür, wann ich mir über die Qualitätskontrolle Sorgen machen sollte. Außerdem wären mehr Experimenttypen großartig – eine Art optimierter Variant-Calling-Pipeline (insbesondere für Krebsstudien) oder scRNA-seq-Analyse wäre schön. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Verifizierter Benutzer in Biotechnologie
BB
Kleinunternehmen (50 oder weniger Mitarbeiter)
"Bioinformatik-Figuren in Pluto"
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Es ist eine benutzerfreundliche Plattform für Laborwissenschaftler, die die Schritte zur eigentlichen Analyse reduziert! Und das Personal von Pluto ist verfügbar und ziemlich reaktionsschnell, um bei Bedarf Probleme zu beheben. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Mehr Webinare wären wünschenswert, wenn man die vielfältigen Aspekte bedenkt, die man auf der Plattform erkunden kann. Und wenn sie die Einzelzelltechnologie widerspiegeln könnten, die zu einem Standard wird, wäre das großartig. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Verifizierter Benutzer in Biotechnologie
BB
Kleinunternehmen (50 oder weniger Mitarbeiter)
"Gute Plattform zum Teilen von Daten"
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Pluto ermöglicht die Zusammenarbeit über Teams hinweg. Es ist sehr hilfreich, alle Daten zu einem bestimmten Muster an einem Ort visualisiert zu haben. Es ist eine großartige Ergänzung zu ELN-Software, bei der der Fokus auf Protokollen und Aufzeichnungen liegt, anstatt auf Visualisierung und Zusammenarbeit. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Beim Hinzufügen neuer Daten zu Pluto für technische Wiederholungen von Experimenten muss eine komplett neue Datei hochgeladen werden und die Grafiken müssen neu erstellt werden, was etwas zusätzliche Zeit in Anspruch nimmt.

Außerdem werden Dezimalzahlen in den Grafiken auf der y-Achse nicht angezeigt. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

HR
Unternehmen (> 1000 Mitarbeiter)
"Früher Benutzer und immer noch ein Fan"
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Ein One-Stop-Shop für all meine RNA-Sequenzierungsbedürfnisse, ohne ein Bioinformatiker sein zu müssen. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Nichts wirklich. Vielleicht hatten einige Dinge am Anfang Fehler, aber ihr Team war großartig darin, sie zu beheben, sodass es kein Problem mehr ist... Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Austin K.
AK
PhD Biomedical Sciences -- Molecular Cell Biology
Kleinunternehmen (50 oder weniger Mitarbeiter)
"Pluto ist ein erstaunliches Werkzeug."
Was gefällt dir am besten Pluto Bio?

Ich liebe es, wie einfach es ist, ein Diagramm aus Bulk-RNAseq-Daten zu erstellen. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

Was gefällt Ihnen nicht? Pluto Bio?

Ich wünschte, es gäbe eine Löschtaste für Projekte, die versehentlich in der Benutzeroberfläche erstellt wurden. Bewertung gesammelt von und auf G2.com gehostet.

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