openBIS é uma plataforma de gestão de dados integrada e de código aberto que combina um Caderno de Laboratório Eletrônico, um Sistema de Gestão de Inventário e uma solução de armazenamento de dados. Desenvolvido pelos Serviços de TI Científica da ETH Zurich, permite que os pesquisadores documentem o trabalho experimental ou computacional diário, armazenem dados brutos e processados relacionados e vinculem tudo a materiais, amostras e protocolos dentro do inventário do laboratório. Este sistema abrangente garante armazenamento seguro de dados, rastreamento de proveniência e conformidade com os princípios de dados FAIR, facilitando dados que são Encontráveis, Acessíveis, Interoperáveis e Reutilizáveis.
Principais Funcionalidades e Características:
- Gestão de Inventário: Organize e rastreie amostras de laboratório, materiais, protocolos e equipamentos, criando um recurso compartilhado acessível a todos os membros do laboratório.
- Caderno de Laboratório Eletrônico: Documente experimentos, vincule-os a itens de inventário e mantenha um registro abrangente das atividades de pesquisa.
- Gestão de Dados: Armazene e gerencie todos os dados relacionados a experimentos de laboratório, incluindo dados brutos, processados e analisados, bem como scripts e notebooks Jupyter.
- Módulo BigDataLink: Utilize o openBIS como um repositório de metadados para grandes conjuntos de dados que não podem ser movidos convenientemente, gerenciando versões de grandes conjuntos de dados em armazenamento na nuvem e HPC.
- Integrações para Análise de Dados: Analise dados armazenados no openBIS usando Jupyter ou MATLAB, com APIs disponíveis para integração em gerenciadores de fluxo de trabalho para análise em grande escala.
- Capacidades de Importação/Exportação: Importe e exporte dados usando Excel, e exporte cadernos de laboratório completos e pastas de inventário para formatos Excel e PDF.
- Gestão de Acesso e Direitos: Controle perfis de usuário e privilégios de acesso, garantindo uma gestão de dados segura e organizada.
- Trilhas de Auditoria: Mantenha um registro de todas as modificações feitas em qualquer entidade no sistema, garantindo a integridade e rastreabilidade dos dados.
- Modularidade: Estenda funcionalidades existentes ou adicione novas escrevendo plugins personalizados, permitindo soluções adaptadas a necessidades específicas de pesquisa.
Valor Principal e Problema Resolvido:
openBIS aborda a necessidade crítica de uma gestão de dados de pesquisa eficiente e em conformidade. Ao integrar a gestão de inventário, ELN e armazenamento de dados em uma única plataforma, ele simplifica os fluxos de trabalho de laboratório, melhora a colaboração e garante a integridade dos dados. Os pesquisadores podem atender aos requisitos crescentes de agências de financiamento, revistas e instituições acadêmicas para publicar dados de acordo com os princípios FAIR, promovendo assim a transparência e a reprodutibilidade na pesquisa científica.