WinMerge é Open Source, funciona tanto para arquivos quanto para pastas e permite até mesmo comparar três arquivos/pastas.

Eu uso muito o WinMerge para revisar as alterações de código em arquivos grandes. O WinMerge tem suporte para até 3 janelas simultâneas de visualização ao mesmo tempo. Também podemos usar diferentes formatos de arquivos de entrada para visualizar e modificar o código. É realmente útil para aqueles que trabalham principalmente com arquivos de texto grandes para rastrear as alterações.

O que eu mais gosto no WinMerge é que ele oferece o conjunto perfeito de recursos para o meu caso de uso. Eu uso a ferramenta com muita frequência para visualizar diferenças entre arquivos de dados estruturados, como XML ou JSON, e sua detecção de blocos movidos, realce de alterações e capacidade de ignorar diferenças de espaço em branco me permitem visualizar as diferenças importantes entre dois arquivos. Gosto que ele me permita fazer comparações de arquivos, mas também fazer comparações em qualquer texto que eu cole na ferramenta instantaneamente. Mas o melhor de tudo é o preço, já que é uma ferramenta de comparação e mesclagem de código aberto e gratuita para Windows.