openBIS est une plateforme de gestion de données intégrée et open-source qui combine un Cahier de Laboratoire Électronique, un Système de Gestion d'Inventaire et une solution de stockage de données. Développé par les Services Informatiques Scientifiques de l'ETH Zurich, il permet aux chercheurs de documenter le travail expérimental ou computationnel quotidien, de stocker les données brutes et traitées associées, et de tout lier aux matériaux, échantillons et protocoles au sein de l'inventaire du laboratoire. Ce système complet assure un stockage sécurisé des données, le suivi de la provenance et la conformité avec les principes FAIR, facilitant des données qui sont Findable, Accessible, Interoperable et Reusable. Caractéristiques et Fonctionnalités Clés : - Gestion d'Inventaire : Organiser et suivre les échantillons de laboratoire, les matériaux, les protocoles et l'équipement, créant une ressource partagée accessible à tous les membres du laboratoire. - Cahier de Laboratoire Électronique : Documenter les expériences, les lier aux éléments de l'inventaire et maintenir un enregistrement complet des activités de recherche. - Gestion des Données : Stocker et gérer toutes les données liées aux expériences de laboratoire, y compris les données brutes, traitées et analysées, ainsi que les scripts et les notebooks Jupyter. - Module BigDataLink : Utiliser openBIS comme un référentiel de métadonnées pour les grands ensembles de données qui ne peuvent pas être déplacés facilement, en gérant les versions de grands ensembles de données sur le cloud et le stockage HPC. - Intégrations pour l'Analyse de Données : Analyser les données stockées dans openBIS en utilisant Jupyter ou MATLAB, avec des API disponibles pour l'intégration dans les gestionnaires de flux de travail pour une analyse à grande échelle. - Capacités d'Import/Export : Importer et exporter des données en utilisant Excel, et exporter des cahiers de laboratoire complets et des dossiers d'inventaire vers les formats Excel et PDF. - Gestion des Accès et des Droits : Contrôler les profils utilisateurs et les privilèges d'accès, assurant une gestion des données sécurisée et organisée. - Piste d'Audit : Maintenir un enregistrement de toutes les modifications apportées à toute entité dans le système, assurant l'intégrité et la traçabilité des données. - Modularité : Étendre les fonctionnalités existantes ou en ajouter de nouvelles en écrivant des plugins personnalisés, permettant des solutions adaptées aux besoins spécifiques de recherche. Valeur Principale et Problème Résolu : openBIS répond au besoin critique d'une gestion efficace et conforme des données de recherche. En intégrant la gestion d'inventaire, le cahier de laboratoire électronique et le stockage de données en une seule plateforme, il rationalise les flux de travail de laboratoire, améliore la collaboration et assure l'intégrité des données. Les chercheurs peuvent répondre aux exigences croissantes des agences de financement, des revues et des institutions académiques pour publier des données selon les principes FAIR, promouvant ainsi la transparence et la reproductibilité dans la recherche scientifique.