Avaliações e Detalhes do Produto Pluto Bio

Plutão facilita para mim organizar meus dados e executar análises de bioinformática, sem precisar programar. Plutão também me permite criar boas figuras representativas por conta própria. Gosto que todos os meus dados possam ser salvos no mesmo lugar e me dá a flexibilidade de criar mais gráficos e interpretações à medida que analiso. Também gosto que eles tenham um recurso de chat responsivo que responde rapidamente às minhas dúvidas. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Seria útil realizar mais tipos de análises estatísticas em Plutão. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Nossa equipe tem pouco conhecimento sobre como analisar dados de transcriptoma usando linguagens de programação complexas (R, Python). Pluto facilita para qualquer um de nós olhar nossos próprios dados e fazer gráficos de barras, gráficos de vulcão, etc. Frequentemente volto e crio novas figuras/análises comparativas em meus conjuntos de dados mais tarde, quando preciso de um novo gráfico. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Eu gostaria de ver ainda mais tipos de análise para escolher no Pluto. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Plutão é útil para compartilhamento de dados e visualização, particularmente para os ensaios biológicos 'simples' que faço. Posso integrar múltiplos ensaios em um único lugar fácil e adicionar tanto imagens quanto texto. É baseado em nuvem, então posso trabalhar nos meus dados de qualquer lugar, até mesmo no meu telefone (o que já fiz antes!). Análise coletada por e hospedada no G2.com.

A barreira para a usabilidade é bastante alta, não consegui integrar tantos colegas quanto gostaria.

Os gráficos não estão prontos para publicação: Quando os valores estão abaixo de 1, não são exibidas casas decimais. As legendas não são editáveis para clareza e não podem incluir unidades.

Na formatação de Dados de Amostra, o Pluto não consegue extrair valores numéricos se o texto estiver incluído. Isso torna impossível adicionar 'alvos' como concentrações (5uM, por exemplo).

Sem modelagem Bliss ou ajuste de curvas para IC50s. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Sou um pesquisador experiente em bioinformática que já experimentou pessoalmente inúmeras plataformas de análise e visualização em vários tipos de -ômicas. Uma grande vantagem desta plataforma é que ela é totalmente integrada de ponta a ponta. Não encontrei outra plataforma que consiga processar grandes arquivos de sequenciamento, realizar controle de qualidade e gerar análises interpretáveis e de qualidade para publicação.

Compartilhei dados através desta plataforma (o que é bastante fácil) com investigadores com experiência limitada em bioinformática. Apesar dessa limitação, a plataforma é tão intuitiva que eles conseguem facilmente entender a análise até aquele ponto e rapidamente são capazes de gerar novas análises. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Os pesquisadores sempre querem mais recursos e análises, então eu gostaria de ver um crescimento contínuo. Eu uso esta plataforma há mais de um ano e fiquei impressionado com o crescimento e desenvolvimento contínuos. Novos experimentos e análises são frequentemente adicionados, mantendo esta plataforma atualizada com o que é necessário para a análise bioinformática, mas será necessário um desenvolvimento contínuo.

Um controle de qualidade extenso é realizado. No entanto, como é gerada muita informação, pode ser difícil saber rapidamente se há problemas com os dados. As notificações de controle de qualidade poderiam ser uma área para melhoria. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

A parte mais útil do Pluto é a seção de métodos que acompanha cada figura. Foi tão fácil escrever o manuscrito quando cada figura tem exatamente o que foi feito para criá-la. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Realmente não havia nada de que eu não gostasse, a única coisa que eu gostaria de ver são mais opções para exibir dados. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Plutão torna fácil a execução das partes mais mundanas do processamento de análise NGS com muito pouco tempo de intervenção do usuário. Como alguém que é bioinformata, eu não gosto de executar as partes básicas das análises de informática (como QC e geração de matrizes de contagem), e Plutão me permite gastar alguns minutos carregando os dados para que eu possa me concentrar nas partes mais complexas das análises posteriores e no desenvolvimento de software. Eles fornecem métricas de QC muito completas e abrangentes, de modo que, se eu precisar modificar ou reexecutar o pipeline, posso facilmente fazer isso copiando o experimento, alterando alguns parâmetros e reexecutando com base nos problemas de QC que vejo. Posso realmente fazer isso em menos de 5 minutos do meu tempo. Também acho que a capacidade de importar estudos GEO desde fastq até a análise é muito poderosa e me poupa muito tempo tentando baixar fastqs e lidando com problemas de largura de banda da internet do SRA e reanalisá-los para serem concordantes com os pipelines e parâmetros que quero usar; a plataforma torna a execução de análises reprodutíveis muito mais simplificada. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Gostaria de ver mais tutoriais/docs/vídeos sobre como interpretar diferentes partes do relatório multiqc e exemplos de quando devo me preocupar com o QC. Além disso, mais tipos de experimentos seriam ótimos -- algum tipo de pipeline de chamada de variantes simplificado (particularmente para estudos de câncer) ou análise de scRNA-seq seria bom. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

É uma plataforma amigável para cientistas de laboratório úmido que reduz as etapas em direção à análise real! E a equipe de Plutão está disponível e bastante responsiva para solucionar problemas sempre que necessário. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Mais webinars seriam apreciados considerando os diversos aspectos que você pode explorar na plataforma. E se puder refletir a tecnologia de célula única, que se torna um dos padrões, seria incrível. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Pluto permite colaboração entre equipes. É muito útil ter todos os dados referentes a uma determinada amostra visualizados em um só lugar. É uma ótima adição ao software ELN, onde o foco está em protocolos e manutenção de registros, em vez de visualização e colaboração. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Ao adicionar novos dados ao Pluto para repetições técnicas de experimentos, um arquivo completamente novo precisa ser carregado e os gráficos precisam ser refeitos, o que leva um pouco de tempo extra.

Além disso, os decimais não são exibidos nos gráficos no eixo y. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Loja única para todas as minhas necessidades de sequenciamento de RNA sem a necessidade de ser um bioinformático. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Nada realmente. Talvez no início algumas coisas tivessem bugs, mas a equipe deles tem sido incrível em consertá-los, então não é mais um problema... Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Eu amo como é fácil criar um gráfico a partir de dados de RNAseq em massa. Análise coletada por e hospedada no G2.com.

Eu gostaria que houvesse um botão de exclusão para projetos feitos por engano na interface do usuário. Análise coletada por e hospedada no G2.com.