Microsoft Genomics ofrece una implementación en la nube del Alineador de Burrows-Wheeler (BWA) y el Kit de Herramientas de Análisis del Genoma (GATK) para análisis secundario. El servicio está certificado por ISO y cumple con las regulaciones de HIPAA, y ofrece previsibilidad de precios para sus necesidades de secuenciación del genoma.